若是没有在集中缴费时间参保，比如在三月份参保的话，会有一个等待期，大概是三个月，等待期是不能申请报销的，或者是补缴的时候把国家财政支付的费用也缴纳了，就能立马申请报销。

第二年年初住院可以申请报销，新农合是一年缴费一次，今年缴的是明年的保险费，每年9—12月集中缴费，缴费成功之后第二年1月1日开始生效，生效之后住院就可以申请报销了。

新农合缴费之后第二年开始生效，每年的9—12月份开始缴费，缴费之后下一年度的1月1日开始生效，保障截止12月31日。每个省份的政策或有不同，具体的以参保地为准。